Philippines : comment l’intelligence artificielle améliore le dépistage de la tuberculose à Tondo, l’un des plus grands bidonvilles de Manille

Des personnes attendent d'être dépistées pour la tuberculose dans une clinique mobile de MSF à Tondo, à Manille. Phillipines, mars 2023
Des personnes attendent d'être dépistées pour la tuberculose dans une clinique mobile de MSF à Tondo, à Manille. Phillipines, mars 2023 © Alice Gotheron/MSF

Dans le bidonville de Tondo, à Manille, capitale des Philippines, toutes les conditions sont réunies pour favoriser la propagation de la tuberculose. Les quartiers surpeuplés abritent des logements insalubres, mal ventilés et à forte humidité. La tuberculose, maladie infectieuse la plus meurtrière au monde, frappe surtout les populations vulnérables : enfants, personnes âgées et individus au système immunitaire affaibli. Depuis 2022, Médecins Sans Frontières (MSF) et leurs partenaires locaux y mènent des actions de dépistage à grande échelle. 

« Nos recherches de cas de tuberculose à Tondo, l'un des bidonvilles les plus surpeuplés au monde, montrent qu'environ 5 % de la population du district est atteinte de la tuberculose, cinq fois plus que la moyenne nationale aux Philippines qui s'établit entre 1 % à 1,5 % », explique Marve Duka, responsable de l'équipe médicale de MSF à Tondo.  

L'apparition progressive et souvent asymptomatique de la tuberculose complique le diagnostic précoce. « Plus de 50 % des personnes diagnostiquées avec la tuberculose dans le cadre de notre programme ne présentent aucun symptôme », explique Marve Duka. « Par conséquent, de nombreux habitants de Tondo ignorent qu’ils sont contaminés avant que leurs symptômes ne deviennent graves et qu’ils cherchent alors à se faire soigner, ce qui augmente le risque de transmission à d'autres personnes dans l’intervalle. » 

De plus, les méthodes classiques de dépistage par l'analyse des expectorations - un type de mucus provenant des toux d'un patient - nécessitent que le niveau de bactérie soit déjà très élevé. Cette méthode donne donc souvent de “faux négatifs” et ne permet pas une détection précoce, indispensable pour prendre en charge efficacement la maladie.

Pour tenter d’améliorer le diagnostic, MSF a mis en place une technologie basée sur l'Intelligence Artificielle qui aide les radiologues à interpréter les radiographies du thorax. Le logiciel de diagnostic assisté par ordinateur (CAD) utilise une nouvelle technologie d'interprétation des images qui examine les radiographies à la recherche d'anomalies ressemblant à une tuberculose pulmonaire. Les résultats de la CAD peuvent être traités en moins d'une minute, aidant les équipes médicales à déterminer si un patient doit être orienté vers des examens complémentaires. Si le résultat du CAD dépasse un certain seuil, cela indique une possibilité d’infection de la tuberculose, et il y aura donc un dépistage supplémentaire via un échantillon d'expectoration. Les échantillons d'expectorations sont envoyés au laboratoire le jour même et les résultats sont généralement disponibles dans un délai de deux à trois jours. Grâce à la CAD, les équipes de MSF peuvent dépister entre 120 et 150 patients par jour. Cela permet donc de mieux détecter les contacts familiaux et de mettre plus rapidement les patients sous traitement. 

Une détection précoce permet de commencer le traitement le plus tôt possible, ce qui réduit considérablement le risque de complications et diminue la transmission de la maladie. Pour les patients, cela signifie une plus grande chance de guérison, moins de soins hospitaliers et une meilleure qualité de vie avec la maladie. 

L'approche globale de MSF en matière de soins antituberculeux à Tondo va au-delà du diagnostic et du traitement. Dès que le diagnostic de tuberculose est confirmé, une équipe de soutien annonce le diagnostic, accompagne et rassure les patients. « Après seulement deux semaines de traitement, les patients ne sont plus contagieux, ce qui est très rassurant pour eux et leurs proches », explique Belen Rance, infirmière membre de l'équipe de soutien aux patients de MSF. 

L'équipe chargée de l’accompagnement des patients participe aussi à la recherche des personnes ayant été en contact avec des malades de la tuberculose. Elle se rend auprès des membres du foyer afin d’identifier ceux qui pourraient avoir été exposés. Les proches, notamment les enfants, peuvent alors être orientés vers une radiographie pulmonaire et, si besoin, bénéficier d’un traitement préventif. 

Cette technologie est actuellement utilisée dans d'autres contextes où la prévalence de la tuberculose est élevée et où les ressources en radiologie sont limitées. « Un autre avantage important du CAD est sa capacité à fonctionner avec des ressources limitées », ajoute Marve Duka. « Dans les zones isolées, où les équipements de diagnostic et les radiologues qualifiés sont rares, l'IA peut aider à combler le fossé. Cette technologie peut être déployée sur des appareils mobiles, ce qui permet au personnel de santé de traiter et d'analyser les radiographies directement dans la communauté, sans avoir besoin d'infrastructures coûteuses. » 

Notes

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