Depuis 2001, MSF menait un programme nutritionnel dans la région de Maradi. Un programme de soutien à deux maternités dans la région d'Agadez avait également démarré en octobre 2007.

Mi-juillet 2008, les autorités nigériennes ont suspendu l'autorisation d'exercice de la section française de MSF.

Après trois mois de démarches infructueuses pour tenter de reprendre les activités, nous avons pris acte de la décision des autorités nigériennes et avons annoncé le 30 octobre 2008 notre départ du pays.

Dépenses 2008 : 7 188 169 €
Financements : 100% privés
Équipe : 16 internationaux, 358 nationaux
Autres sections MSF présentes : sections belge (région de Maradi) ; espagnole (régions de Tahoua et d'Agadez) ; suisse (région de Zinder), avec des activités nutritionnelles principalement, mais aussi une réponse aux urgences (vaccination lors d'une épidémie de rougeole en 2008, de méningite en 2009) et soutien à des centres de santé dans la région affectée par le conflit touareg.