Après neuf années d'absence, la section française de Médecins Sans Frontières est retournée en 2007 en Somalie, pour y mener deux programmes : soins de santé primaires et secondaires à Jamaame et service de chirurgie d'urgence à Mogadiscio.

A partir d'avril 2008, suite à l'assassinat de trois volontaires de la section hollandaise de MSF survenu fin janvier et à l'augmentation des enlèvements et des menaces pesant sur ses équipes de secours, MSF a décidé de ne plus maintenir en permanence des équipes internationales en Somalie.

C'est donc par la présence du personnel somalien que les projets continuent d'exister, avec le soutien des équipes internationales basées à Nairobi.

Dépenses 2008 : 2 901 439 €
Financements : 100 % privés
Equipe : 9 internationaux, 50 nationaux
Autres sections MSF présentes : hollandaise, belge, espagnole et suisse.